Filip Boyen studeerde als dierenarts af in 2002 aan de UGent en behaalde zijn doctoraat in 2007 aan het Laboratorium voor Bacteriologie en Mycologie van de Huisdieren aan dezelfde universiteit met als onderwerp Salmonella infecties bij varkens. In 2010 werd hij Diplomate bij de European College of Porcine Health Management en sinds 2019 Diplomate bij de European College of Veterinary Microbiology. Momenteel werkt hij als Laboratoriumadviseur aan hetzelfde laboratorium, waarbij hij zowel onderwijs, onderzoek, als dienstverlening aan derden verzorgt. Zijn onderzoek handelt voornamelijk over de diagnose van bacteriële infecties bij verschillende diersoorten.